展览以“中医药学是中国古代科学的瑰宝，也是打开中华文明宝库的钥匙”为指导思想，揭示中医药学追求“天人合一、调和致中”的至真之理，践行“仁心仁术、厚德济生”的至善之道，从而“发现中医之美”。

内容从生命到生活为逻辑思路，设置序厅、六个单元和尾厅。序厅总览中医药的世界地位及其源远流长、丰富多彩的特点。一单元“天人合一”，展示中医在阴阳五行理论的指导下对人体生命与健康、疾病的认知。二单元“仁心仁术”，展示中医对疾病的诊断与内、外、妇、儿、五官等各科疾病的治疗。三单元“对症下药”，展示从本草典籍、药材炮制到临床组方和制剂的中药治病疗法。第四单元“手到病除”，展示针刺、艾灸、刮痧、拔罐、推拿、导引等非药物疗法。五单元“防患未然”，展示中国古代对传染病的认识、治疗和各方面的预防卫生措施。六单元“颐养之道”，也即“中医养生文化展”，展示中医的健康理念和在起居、饮食、运动、精神上的养生原则和方法。尾厅以中医药在新时代下传承精华、守正创新的举措和成就作为总结。